MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 109595

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012943	GC	3	6	228212	228217	0 %	0 %	50 %	50 %	253797116
5502	NC_012943	CGG	2	6	228232	228237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797116
5503	NC_012943	CAACGC	2	12	228239	228250	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	253797116
5504	NC_012943	GTT	2	6	228286	228291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253797116
5505	NC_012943	GAC	2	6	228299	228304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797116
5506	NC_012943	AGG	2	6	228345	228350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253797116
5507	NC_012943	TGC	2	6	228351	228356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797116
5508	NC_012943	CGC	2	6	228395	228400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797116
5509	NC_012943	CGA	2	6	228472	228477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797116
5510	NC_012943	GT	3	6	228566	228571	0 %	50 %	50 %	0 %	253797116
5511	NC_012943	GCA	2	6	228604	228609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797116
5512	NC_012943	CACC	2	8	228641	228648	25 %	0 %	0 %	75 %	253797116
5513	NC_012943	CGC	2	6	228665	228670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797116
5514	NC_012943	CTG	2	6	228671	228676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797116
5515	NC_012943	CTG	2	6	228707	228712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797116
5516	NC_012943	TGG	2	6	228714	228719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797116
5517	NC_012943	CTG	2	6	228740	228745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797116
5518	NC_012943	CGC	2	6	228785	228790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797116
5519	NC_012943	TGG	2	6	228809	228814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797116
5520	NC_012943	CGT	2	6	228922	228927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797116
5521	NC_012943	GCCTGG	2	12	228945	228956	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253797116
5522	NC_012943	GAC	2	6	228968	228973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797116
5523	NC_012943	CCG	2	6	229002	229007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797116
5524	NC_012943	GTG	2	6	229064	229069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797116
5525	NC_012943	TGG	2	6	229086	229091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797116
5526	NC_012943	GCT	2	6	229093	229098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797116
5527	NC_012943	CAC	2	6	229132	229137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797116
5528	NC_012943	CGG	2	6	229196	229201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797116
5529	NC_012943	CGG	2	6	229248	229253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797116
5530	NC_012943	GAC	2	6	229319	229324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797116
5531	NC_012943	GCT	2	6	229354	229359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797116
5532	NC_012943	TAC	2	6	229367	229372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797116
5533	NC_012943	ACC	2	6	229403	229408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797116
5534	NC_012943	TCGG	2	8	229454	229461	0 %	25 %	50 %	25 %	253797116
5535	NC_012943	TGT	2	6	229494	229499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253797116
5536	NC_012943	CGA	2	6	229531	229536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797116
5537	NC_012943	GCG	2	6	229547	229552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797116
5538	NC_012943	GGC	2	6	229555	229560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797116
5539	NC_012943	GCT	2	6	229576	229581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797116
5540	NC_012943	CGT	2	6	229596	229601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797116
5541	NC_012943	CGG	2	6	229605	229610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797116
5542	NC_012943	GTG	2	6	229632	229637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797116
5543	NC_012943	CCGG	2	8	229715	229722	0 %	0 %	50 %	50 %	253797116
5544	NC_012943	GGT	2	6	229729	229734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797116
5545	NC_012943	TCG	2	6	229737	229742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797116
5546	NC_012943	TGG	2	6	229779	229784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797116
5547	NC_012943	ACGG	2	8	229932	229939	25 %	0 %	50 %	25 %	253797116
5548	NC_012943	GAT	2	6	229996	230001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797116
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5550	NC_012943	CTG	3	9	230117	230125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797116
5551	NC_012943	GTG	2	6	230165	230170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797116
5552	NC_012943	CACCCT	2	12	230179	230190	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	253797116
5553	NC_012943	GAC	2	6	230203	230208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797116
5554	NC_012943	GCT	2	6	230312	230317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797116
5555	NC_012943	GGC	2	6	230341	230346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797116
5556	NC_012943	AACT	2	8	230564	230571	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5557	NC_012943	TGT	2	6	230704	230709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_012943	GGAA	2	8	230739	230746	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_012943	CAC	2	6	230747	230752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5560	NC_012943	G	6	6	230754	230759	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_012943	GAG	2	6	230805	230810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253797117
5562	NC_012943	TCC	2	6	230815	230820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253797117
5563	NC_012943	GGT	2	6	230867	230872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797117
5564	NC_012943	GCGA	2	8	230874	230881	25 %	0 %	50 %	25 %	253797117
5565	NC_012943	GC	3	6	230939	230944	0 %	0 %	50 %	50 %	253797117
5566	NC_012943	CCA	2	6	230986	230991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797117
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5576	NC_012943	GCC	2	6	231279	231284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797117
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5579	NC_012943	CGCA	2	8	231429	231436	25 %	0 %	25 %	50 %	253797117
5580	NC_012943	TGCGC	2	10	231449	231458	0 %	20 %	40 %	40 %	253797117
5581	NC_012943	TGAT	2	8	231471	231478	25 %	50 %	25 %	0 %	253797117
5582	NC_012943	ACGT	2	8	231491	231498	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5583	NC_012943	GGCCG	2	10	231501	231510	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5584	NC_012943	GTG	2	6	231522	231527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_012943	ACAT	2	8	231558	231565	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5586	NC_012943	GCG	2	6	231580	231585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_012943	TGG	2	6	231608	231613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797118
5588	NC_012943	TGC	2	6	231671	231676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797118
5589	NC_012943	GCG	2	6	231683	231688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797118
5590	NC_012943	ACT	2	6	231710	231715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797118
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5592	NC_012943	G	6	6	231798	231803	0 %	0 %	100 %	0 %	253797118
5593	NC_012943	GCT	2	6	231810	231815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797118
5594	NC_012943	CAG	2	6	231841	231846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797118
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5597	NC_012943	CG	3	6	231942	231947	0 %	0 %	50 %	50 %	253797118
5598	NC_012943	GCG	2	6	231952	231957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797118
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5601	NC_012943	CGC	2	6	232100	232105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797118
5602	NC_012943	CTG	3	9	232135	232143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797118
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5605	NC_012943	CGA	2	6	232241	232246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797119
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5609	NC_012943	GAG	2	6	232392	232397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253797119
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5612	NC_012943	CGG	4	12	232484	232495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797119
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5615	NC_012943	CGG	2	6	232619	232624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797119
5616	NC_012943	CG	3	6	232630	232635	0 %	0 %	50 %	50 %	253797119
5617	NC_012943	TCG	2	6	232666	232671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797119
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5619	NC_012943	GAT	2	6	232751	232756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797119
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5621	NC_012943	CGT	2	6	232769	232774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797119
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5985	NC_012943	CCA	3	9	247582	247590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797129
5986	NC_012943	GCG	2	6	247593	247598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797129
5987	NC_012943	TCG	2	6	247617	247622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797129
5988	NC_012943	CCAC	2	8	247711	247718	25 %	0 %	0 %	75 %	253797129
5989	NC_012943	ACC	2	6	247725	247730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797129
5990	NC_012943	CGGC	2	8	247794	247801	0 %	0 %	50 %	50 %	253797129
5991	NC_012943	CAG	2	6	247823	247828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797129
5992	NC_012943	CGGC	2	8	247871	247878	0 %	0 %	50 %	50 %	253797129
5993	NC_012943	TCA	3	9	248050	248058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797129
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